És una de las mezquitas que mayor significado tiene para los musulmanes por ser la primera construida en Medina y por haber sido planificada por el mismo Profeta Muhammad, sallallahu ‘alaihi wa sallam, sin mencionar que él, sallallahu ‘alaihi wa sallam, participó en su construcción, mientras permaneció con los Banu ‘Amru Ibn ‘Auf, antes de sus arribo a Medina.
Él Imam de esta mezquita fue Salim Maula (esclavo liberto de) Abu Hudhaifah, y detrás de él rezaban los más grandes e importantes de los Sahabah. Él Profeta, sallallahu ‘alaihi wa sallam, acostumbraba a visitarla constantemente, iba en su montura o a pié, como nos lo relata Ibn ‘Ümar, que Al-lah esté complacido con él.
Én cuanto a sus virtudes nos dijo el Profeta, sallallahu ‘alaihi wa sallam: “Orar en la mezquita de Quba’ es como hacer ‘Ümrah (peregrinación menor)” [At-Tirmidhi]. Por tal razón, los musulmanes que viven en Medina o que llegan a ella de visita, tratan de ir para orar en esta mezquita, que es uno de los lugares más representativos de la ciudad del Profeta Muhammad, sallallahu ‘alaihi wa sallam.