Él nombre que tiene esta mezquita nos indica un hecho singular vivido en el tiempo del Profeta Muhammad, sallallahu ‘alaihi wa sallam. Én un principio los musulmanes hacían sus oraciones dirigiéndose hacia Bait Al Maqdis (Jerusalén), posteriormente Al-lah, Él Altísimo, Ordenó que se orientaran hacia Al Ka’bah, en la Meca, Dice Al-lah (lo que se interpreta así en español): {Vemos que vuelves tu rostro hacia el cielo. Te orientaremos a una dirección [ Qiblah ] que te agrade; oriéntate, pues, hacia la Mezquita Sagrada [La Meca]. Y dondequiera que estéis, orientaos hacia ella. La Gente del Libro sabe que es la Verdad de su Señor. Y Al-lah no está desatento de lo que hacen} [Corán, 2: 144].
La Mezquita de Qiblatain está en la parte sur oeste de Medina, cerca del valle Al ‘Aqiq, sobre una pequeña loma y a 5 kilómetros de la Mezquita del Profeta, sallallahu ‘alaihi wa sallam. La Mezquita cuenta con amplias y cómodas instalaciones. Dentro de la sala de oración hay un elevado exclusivo para las mujeres.