Die Moschee gehört zu den bedeutenden Moscheen im Islâm, denn es ist die erste Moschee, die in der Umgebung von Madîna errichtet wurde. Der Prophet plante ihre Errichtung und half bei ihrem Bau mit, als er beim Stamme Banû Amr ibn Auf war. Er besuchte öfter diese Moschee.
Der Gefährte Sâlim leitete dort das Gebet. Es wurde von Ibn Umar überliefert, dass Sâlim , der Diener von Abû Hudhaifa, das Gebet unter den ersten Auswanderern und den Gefährten des Propheten in der Moschee Al-Qubâ leitete; unter ihnen befanden sich Abû Bakr, Umar, Abû Salama, Zaid und Âmir ibn Rabî'a.
Es ist von Ibn Umar überliefert, dass der Prophet reitend und gehend zur Moschee Qubâ gelangte und dort zwei Rak´as betete. (Überliefert von Muslim.)
At-Tirmidhî berichtet in seinem Sahîh-Werk, dass der Prophet sagte: „Das Gebet in der Moschee (Qubâ) kommt einer Umra gleich.“
Deswegen maßen die Muslime dieser Moschee einen hohen Wert bei und erneuerten diese von Zeit zu Zeit. So wurde diese Moschee zu einem der Sehenswürdigkeiten von Madîna, die von vielen Muslimen besucht wird.